Centro di Biologia Computazionale

Centro di Biologia Computazionale

Il Centro di Biologia Computazionale si occuperà di analizzare ed interpretare l’immensa mole di dati generata da tutti gli altri centri, sviluppando modelli ed elaborando ipotesi per approfondire la nostra comprensione dei processi biologici ed il loro impatto sulla salute umana ed in risposta alle terapie. Integrerà il lavoro del Centro di Genomica, utilizzando un approccio computazionale e bioinformatico per studiare i processi biologici associati alla malattia. Il Centro si occuperà inoltre dello sviluppo di nuovi metodi di analisi delle immagini, rilevanti per molte aree della biomedicina.

Computational Biology Publications

Pubblicazioni

Analysis of CRISPR‐Cas9 screens identify genetic dependencies in melanoma

Eirini Christodoulou, Mamunur Rashid, Clare Pacini, Droop Alastair, Holly Robertson, Tim van Groningen, Amina.F.A.S Teunisse, Francesco Iorio, A.G. Jochemsen, David.J. Adams, Remco van Doorn

2020 - Pigment Cell and Melanoma Research

LINK


Drug mechanism‐of‐action discovery through the integration of pharmacological and CRISPR screens

Emanuel Gonçalves, Aldo Segura‐Cabrera, Clare Pacini, Gabriele Picco, Fiona M Behan, Patricia Jaaks, Elizabeth A Coker, Donny van der Meer, Andrew Barthorpe, Howard Lightfoot, Tatiana Mironenko, Alexandra Beck, Laura Richardson, Wanjuan Yang, Ermira Lleshi, James Hall, Charlotte Tolley, Caitlin Hall, Iman Mali, Frances Thomas, James Morris, Andrew R Leach, James T Lynch, Ben Sidders, Claire Crafter, Francesco Iorio, Stephen Fawell, Mathew J Garnett

2020 - Molecular Systems Biology

LINK


Identification of Intrinsic Drug Resistance and Its Biomarkers in High-Throughput Pharmacogenomic and CRISPR Screens

Iñigo Ayestaran, Ana Galhoz, Elmar Spiegel, Ben Sidders, Jonathan R. Dry, Frank Dondelinger, Andreas Bender, Ultan McDermott, Francesco Iorio, Michael P. Menden

2020 - Patterns

LINK


CELLector: Genomics-Guided Selection of Cancer In Vitro Models

Hanna Najgebauer, Mi Yang, Hayley E. Francies, Clare Pacini, Euan A. Stronach, Mathew J. Garnett, Julio Saez-Rodriguez, Francesco Iorio

2020 - Cell Systems

LINK


Agreement between two large pan-cancer CRISPR-Cas9 gene dependency data sets

Joshua M. Dempster, Clare Pacini, Sasha Pantel Fiona M. Behan, Thomas Green, John Krill-Burger, Charlotte M. Beaver, Scott T. Younger, Victor Zhivich, Hanna Najgebauer, Felicity Allen, Emanuel Gonçalves, Rebecca Shepherd, John G. Doench, Kosuke Yusa, Francisca Vazquez, Leopold Parts, Jesse S. Boehm, Todd R. Golub, William C. Hahn, David E. Root, Mathew J. Garnett, Aviad Tsherniak, Francesco Iorio

2019 - Nature Communications

LINK